În lumea SF-ului există această idee interesantă că în viitorul îndepărtat vom putea coloniza spațiul cu ajutorul clonelor umane. Datorită distanțelor foarte mari dintre stele, călătoria cu ajutorul sistemelor de propulsie actuale ar dura foarte mult și atunci clonarea sau biosinteza ar fi soluții alternative la problema călătoriilor spațiale. Odată cu avansul tehnologic ideea a căpătat diferite nuanțe. Între toate, una plauzibilă din punct de vedere al cunoștințelor științifice actuale ar fi aceea de a trimite roboți care să cloneze/biosintetizeze oameni, odată ce au ajuns pe o nouă planetă care poate susține viața de tip terestru. Copii ale genomurilor umane de interes, stocate în memoria roboților ar fi decodificate și traduse în materie organică, obținând-se în final replici ale unor oameni care au trăit cândva pe Pământ sau variante noi ameliorate/îmbunătățite prin intervenție asupra genomurilor inițiale.
Etichetă: genom
Integrative Genomics Viewer
Dacă ar fi să descriu Integrative Genomics Viewer (IGV) în două cuvinte, acestea ar fi: atlas genomic… Cu alte cuvinte, IGV este o aplicație de tip software cu ajutorul căreia poți să navighezi prin genom pe verticală (de la nivel de nucleotidă, până la cel de cromozom și invers) și pe orizontală (la nivel de secvență, de la un cap la altul în cromozom).
IGV se prezintă sub forma a două versiuni: aplicație pentru desktop sau de tip browser. Prima variantă are nevoie de Java pentru a funcționa, care poate fi instalat separat sau integrat deja în aplicație, pe când cea de tip browser nu are asemenea dependențe deoarece majoritatea browsere-lor actuale suportă Java, însă este mai „ușoară” când vine vorba de posibilități de utilizare. Așadar, versiunea desktop este preferată de analiști, pe când cea browser de companiile care furnizează servicii de secvențiere și care cu ajutorul acestei versiuni oferă pe site-urile lor o previzualizare a rezultatelor oferite. Voi vorbi mai departe de versiunea desktop, însă dacă sunteți curioși despre cum arată versiunea browser sau de cum poate fi integrată pe un website propriu, urmați aceste legături: IGV online sau IGV-Web Documentation.
În sfârșit, mi-am secvențiat genomul (III)
(Continuare…)
Citește articolele anterioare (articol I, articol II).
Am reușit să obțin rezultatele secvențierii genomului meu după mai mult de opt săptămâni, cât era termenul declarat de laborator. După o conversație cu cei de la Dante Labs am aflat că au fost probleme cu furnizarea reactivilor în Italia din cauza pandemiei Covid 19 (valul 2 și 3). În timp ce m-am apucat să scriu aceste rânduri am observat că a fost vorba mai mult de atât, Dante Labs trecând printr-o etapă de rebrend-uire (extinderea paletei de servicii) și după ultimele date de pe website-ul lor oficial asta s-ar datora fuzionării sau achiziționării sale de către o firmă din SUA. În fine… pentru răbdarea și empatia de care am dat dovadă, în ceea ce privește eforturile lor, mi-au oferit gratuit un raport de interpretare a rezultatelor, la alegere, din suita de rapoarte suplimentare disponibile.
În sfârșit, mi-am secvențiat genomul (II)
(Continuare…)
Citește și celelalte articole (articol I, articol III).
Pe 24 noiembrie 2020 am cumpărat, la o ofertă de Black Friday, kit-ul 30X Whole Genome Sequencing Test de la Dante Labs,
Pe 25 noiembrie am primit AWB-ul și instrucțiunile de retur. Pe 28 noiembrie kit-ul a plecat din Lahr, un oraș din sud-vestul Germaniei și l-am primit pe 07 decembrie (după aproape 2 săptămâni). Aș fi obținut coletul mai devreme cu 2-3 zile dacă nu m-aș fi bâlbâit cu firma de curierat (eu așteptând să vină prin Poșta Română, luându-mă după datele din instrucțiunile de retur).
În sfârșit, mi-am secvențiat genomul (I)
Specia umană este alcătuită din populații, iar populațiile din indivizi. Organismul unui singur individ este compus din sisteme de organe și organe, care sunt compuse la rândul lor din țesuturi, țesuturile din celule, celulele din membrană, citoplasmă, organite și nucleu. În nucleu și în unele organite (mitocondrii) se găsește ADN-ul, care codifică pentru toate structurile amintite anterior și nu numai. ADN-ul la rândul lui este compus din patru tipuri de nucleotide. Nucleotidele… ei bine, putem merge tot așa până la atomi și dincolo de ei, dar nu ar avea rost pentru subiectul acestui articol. Totalitatea ADN-ului dintr-o celulă se numește genom. Cu excepția gemenilor monozigoți și a clonelor, în primele clipe de viață, toate organismele (superioare) au un ADN unic din punct de vedere al informației pe care acesta o codifică.